Options of free software for researchers to work with academic literature.
Programas gratuitos para academicos e investigadores.

Docear.
Es una suite integrada de herramientas open source y multiplataforma para investigar, organizar y crear documentos académicos: una biblioteca digital, lector de PDF, hacer notas y mapa mental. Es desarrollado por científicos y universidades.
http://www.docear.org/tag/freeplane/

Mendeley
Mendeley es una aplicación web y de escritorio, propietaria y gratis. Permite gestionar y compartir documentos de investigación,1 encontrar nuevos datos y colaboración en línea. Mendeley combina Mendeley Desktop una aplicación de gestión de PDFs y gestión de referencias (disponible para Windows, Mac y Linux) con Mendeley web, una red social online para investigadores.
http://www.mendeley.com/

Zotero
Zotero es una programa de código abierto para el navegador Firefox, que permite a los usuarios recolectar, administrar y citar investigaciones de todo tipo de orígenes del navegador. Es parcialmente una aplicación de administración de referencias, usada para administrar bibliografías y referencias al escribir ensayos y artículos.
http://www.zotero.org/

LyX
Es un programa gráfico multiplataforma creado por Matthias Ettrich que permite la edición de texto usando LaTeX, por lo que «hereda» todas sus capacidades (notación científica, edición de ecuaciones, creación de índices, etcétera). Es un procesador de texto para escribir documentos como, papers académicos y tesis.
http://www.lyx.org/